Muitos historiadores acreditam que as Filipinas foram colonizadas no Paleolítico, quando um povo asiático atravessou por meio de pontes de madeira o caminho que leva à região. Descobertas mais recentes, no entanto, parecem indicar que as ilhas podem ter sido habitadas desde a era pleitocênica. Os primeiros humanos nestas ilhas, no entanto, pouco teriam a ver com os actuais, sendo pigmeus, parecendo não ter resistido às seguintes migrações.